Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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