Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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