Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms