Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXE3Q13461 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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