Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SGCGQ13326 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SGCGQ13326 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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SGCGQ13326 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SGCGQ13326 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SGCGQ13326 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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