Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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