Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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