Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms