Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTP4A2Q12974 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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