Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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