Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms