Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD300CQ08708 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms