Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB2Q08289 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB2Q08289 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms