Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK18Q07002 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms