Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEUP1Q05D60 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms