Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLCB3Q01970 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms