Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms