Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPCQ01831 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPCQ01831 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms