Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms