Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3F3AP84243 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3AP84243 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3AP84243 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms