Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMF1P82094 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms