Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms