Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO4P61968 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO4P61968 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO4P61968 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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