Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP107P57740 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms