Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA1P56159 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA1P56159 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms