Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPAP53621 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPAP53621 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPAP53621 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.6 ms