Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFIP1P53367 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms