Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX2P52951 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBX2P52951 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBX2P52951 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBX2P52951 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms