Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRCA2P51587 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms