Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB28P51157 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms