Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB9AP51151 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB9AP51151 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB9AP51151 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB9AP51151 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB9AP51151 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RAB9AP51151 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9AP51151 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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RAB9AP51151 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9AP51151 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RAB9AP51151 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RAB9AP51151 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9AP51151 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9AP51151 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9AP51151 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9AP51151 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9AP51151 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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