Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCR1P46094 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms