Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms