Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTHFRP42898 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTHFRP42898 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms