Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBX2P40425 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBX2P40425 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBX2P40425 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBX2P40425 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBX2P40425 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBX2P40425 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBX2P40425 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBX2P40425 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms