Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK1P39086 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms