Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms