Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFNP31947 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SFNP31947 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFNP31947 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms