Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPS1P31327 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPS1P31327 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPS1P31327 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPS1P31327 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms