Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms