Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms