Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IL3RAP26951 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms