Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms