Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTPRGP23470 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms