Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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