Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGCP20142 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGCP20142 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms