Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC9A1P19634 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms