Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CTLA4P16410 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CTLA4P16410 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CTLA4P16410 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CTLA4P16410 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CTLA4P16410 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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