Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREB1P16220 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREB1P16220 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREB1P16220 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREB1P16220 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREB1P16220 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREB1P16220 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREB1P16220 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREB1P16220 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms