Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-EP13747 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-EP13747 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-EP13747 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-EP13747 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-EP13747 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-EP13747 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms